引起玫瑰糠疹的病因研究并不是特别清楚。主要考虑与感染，药物因素，自身免疫，遗传性过敏等各种学说，其中与病毒感染学说可能性最大。
首先，玫瑰糠疹的发病与季节性变化有关，以春秋记号发可有先驱症状和近期才出现过上呼吸道感染症状。人与人之间的传播虽未得到证实，但有群集性发病的现象偶尔发生在家庭、学校和同事住在一起的密切接触的人同时或相继发病。表明本病可能是一种弱传染病，很可能与病毒感染相关。其次，许多药物也可诱发玫瑰糠疹或玫瑰糠疹样疹，包括砷剂，有机汞，干扰素，异维A酸，甲硝唑，酮替芬，特比萘芬，可乐定，奥美拉唑，氯喹，秋水仙碱，卡介苗，乙肝疫苗等。
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另外，患玫瑰糠疹的患者显示特异性较常见，患脂溢性皮炎，寻常型痤疮，头皮屑的患者及孕妇中玫瑰糠疹的发病率较高，骨髓移植后可见玫瑰糠疹样疹反应。处于应激状态或精神高度紧张状态的人中，患玫瑰糠疹更为多见，但玫瑰糠疹不是心身性疾病。
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